塞罗奥特曼在本作中与红莲火焰、镜子骑士、詹伯特阻止天体的运转,并结识了詹奈。

诞生在宇宙群星之间的神秘种子，以帮助智慧生命突破文明瓶颈为使命，它们被称之为“超神学院”。超神学院孕育着成为神，乃至超越神的强大生命体。当星际战争降临，这些被创造出来的“神”，将不可避免地卷入宇宙纷争，变成宇宙中最绚烂的星辰，或是毁灭万物的武器！

塞罗奥特曼在本作中与红莲火焰、镜子骑士和詹伯特阻止天体的运转，并结识了詹奈。

贝利亚军团被毁灭后，赛罗奥特曼与火焰战士、镜子骑士、钢铁武士组成了“终极赛罗警备队”。现在他们准备再次拜访艾美拉娜公主。因为钢铁武士等不及面见公主殿下，所以他就率先出发了。没想到等赛罗、火焰战士、镜子骑士赶到的时候，却发现钢铁武士抱着公主殿下的飞船，被神秘星球给抓住了。另一边，雷与日向船长驾驶飞船前往行星布拉姆，准备去海边度假。没想到在飞行的路上，眼前突然出现了之前赛罗他们遇到的神秘星球。日向船长拜托熊野队员帮忙调查这颗星球的情况，随后雷和日向船长驾驶飞船潜入了星球的内部。在星球内部雷和日向遇到了艾美拉娜